Numa ótica de partilha e otimização de recursos foi formalizada a parceria, já existente entre ambas as instituições . A fundação constitui-se como um recurso para a lecionação de aulas de História, Artes, entre outras áreas de ensino, a serem desenvolvidas no edifício sede da fundação, e em particular na Casa Museu Dr Rafael Duque. Também recebe jovens em formação em contexto de trabalho do curso profissional de Multimédia deste agrupamento. Tem representação no Conselho Geral enquanto instituição da comunidade, permitindo-lhe dar o seu contributo para a promoção do desenvolvimento das crianças e jovens que frequentam este Agrupamento.  Atribui anualmente, numa política de incentivo ao desenvolvimento académico, o Prémio Dr. Rafael Duque. O Agrupamento de Escolas também disponibiliza os seus equipamentos para, caso se entenda necessário, poderem ser desenvolvidas atividades da fundação nos seus espaços.